ログの保持期間とは、SQL Serverに保存したログを保持する
期間です。この期間を過ぎるとSQL Server内のデータが
削除されます。
一方、ログの取り込み時に「取り込んだファイルを保持する」を
選択している場合、Auto_Logフォルダに取り込んだファイルの
控えを保管していますが、ログの保持期間を過ぎていても、
Auto_Logフォルダ内のファイルは削除されません。
自動取り込みの対象は、過去に取り込んだ履歴のない
InterSafeサーバ上のログと、Auto_Logフォルダ内のログが対象
ですので、InterSafeサーバ上のログファイルが削除されていても、
Auto_Logフォルダ内に保管されているログの控えが
再度取り込まれてしまいます。
定期的にAuto_Logフォルダも適宜バックアップおよび削除を
するようにしてください。