root、guestユーザーをLDAPサーバ上に登録しないようにしてください。

■アカウント名「root」で認証した場合
　LDAP連携時でも、「root」で認証した場合はLDAPサーバ側へ
　ユーザの問い合わせは行いません。そのため、LDAPサーバ上の
　rootユーザではInterSafe WebFilterサーバで認証できなくなります。

■アカウント名「guest」で認証した場合
　InterSafe WebFilterサーバ上と、LDAPサーバ上に、異なる「guest」
　ユーザーが存在する場合、LDAPサーバ上の「guest」ユーザーは、
　InterSafe WebFilterサーバ上の「guest」ユーザーが所属するグループ
　としてフィルタリングを行います。
　つまり、LDAPサーバから、「guest」ユーザーを取り込んで、
　別のグループに移動した状態となります。

■グループだけ取り込んだ場合
　LDAPサーバから、グループだけの取り込みを行った場合、
　すでに「root」および「guest」アカウントがInterSafe WebFilterサーバ
　上に存在するので、LDAPサーバ上のグループではなく、
　InterSafe WebFilterサーバ上のグループのユーザとしてフィルタリングを
  行います。